该市的总面积为89.6平方英里（232.1平方千米）；其中陆地面积为48.4平方英里（125.4平方千米），水域面积为41.2平方英里（106.7平方千米，占46.0%）。而其它许多人口相仿的城市，如丹佛有154.9平方英里，而夏洛特有280.5平方英里。在50万人口以上的美国城市中，只有旧金山和华盛顿的面积小于波士顿。波士顿的海拔高度，以洛根国际机场为标准，是19英尺（5.8米）。波士顿的最高点是贝勒维尔山，海拔330英尺（101米）。与波士顿毗邻的城镇有温索普、里维尔、切尔西、艾弗瑞、萨默维尔、剑桥、水城、牛顿、布鲁克兰、尼达姆、戴得汉姆、坎顿、米尔顿和昆西，通常都被认为是大波士顿的一部分。
波士顿公园（Boston Common）位于金融区和灯塔山附近，是美国最古老的公园。连同附近的波士顿公共花园，都属于“翡翠项链”（一系列环绕城市的公园）的一部分。
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