航空
敦煌机场位于敦煌市东13公里处，现开通有敦煌至嘉峪关、兰州、西安、乌鲁木齐的固定航线和敦煌至北京等地的旅游包机航线，正班和包机航线均可随时包租加班机。民航售票处设在阳关东路12号（敦煌宾馆斜对面）。
铁路
柳园（敦煌）火车站距市区130公里，西部地区的铁路大动脉——兰新铁路从敦煌境内穿过，每天有7对客车通过，可直达上海、北京、郑州、青岛、西安、兰州、嘉峪关、成都、哈密、吐鲁番、库尔勒、鄯善、乌鲁木齐、阿克苏等城市。旅游高峰期还开通了柳园至乌鲁木齐的豪华旅游专列，同时在各车次可随时加挂卧铺车厢。
长途客运
公路网络四通八达。东北向通过安敦公路，西北向通过柳敦公路，分别在安西和柳园与312国道相连，可通往嘉峪关、兰州、西安、哈密、吐鲁番、乌鲁木齐等城市，柳敦公路向南延伸，有通向青海格尔木和西藏拉萨的215、109国道，敦煌已成为西部地区重要的交通枢纽。
出租车
出租车起步价都为5块，1.6升以上排量的车辆以2公里为基价，此后每公里收取1.4元；1.6升以下排量的车辆以3公里为基价，此后每公里1.2元；10公里以上单程回空里程费是每公里6毛钱。
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